Purtătorul de cuvânt al Telegramului, Remi Vaughn, a negat declarațiile din Wired făcute de șeful WhatsApp, Will Cathcart, despre securitatea aplicației. Potrivit lui Vaughn, articolul Wired conține multe erori, iar echipa editorială a ignorat comentariile și răspunsurile Telegram, care la rândul lor l-au indus în eroare pe Cathcart. Telegram a compilat o listă de 9 erori în articolul Wired, care poate fi găsită la telegra.ph (un instrument minimalist de postare Telegram). Postarea se termină cu „Această listă se extinde”. Această postare abordează mai multe afirmații din articolul Wired, inclusiv cea privind urmărirea locației, care este posibilă numai dacă utilizatorul își face în mod explicit publică locația, lucru pe care doar 0,01% dintre utilizatori au făcut-o, potrivit Telegram.
În ceea ce privește confidențialitatea chaturilor secrete, Vaughn subliniază că Cathcart greșește când afirmă că protocolul Telegram End To End Encryption (E2EE) nu a fost verificat independent. O echipă de la Universitatea din Udine din Italia a verificat protocolul MTProto 2.0 folosit de Telegram pentru a-și proteja chat-urile. Aplicația Telegram este open source și a folosit versiuni reproductibile începând cu versiunea 5.13. Serverele Telegram nu sunt open source, dar echipa Udine a verificat și protocolul MTProto 2.0 pe aceste servere.
Totuși, ei subliniază o problemă care ar putea compromite securitatea chaturilor secrete: atunci când începe un chat secret, este vital ca utilizatorul să verifice amprenta cheilor de autentificare printr-un canal extern securizat. În caz contrar, sunt posibile atacuri de tip man-in-the-middle, ceea ce înseamnă că o terță parte poate asculta sau chiar modifica mesajele. Cercetătorii observă că această eroare de utilizator este posibilă și atunci când se utilizează aplicația Signal.